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Journal : Theoretical and Applied Genetics (2005)
Facteur d’impact à 2 ans : 3,063
Notoriété à 2 ans : Exceptionnelle (agronomy ; horticulture)
Article
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URL
http://prodinra.inra.fr/record/18659
Titre. sous titre
Genetic diversity among alfalfa (Medicago sativa) cultivars coming from a breeding program using SSR markers
Auteur(s)
Sandrine Flajoulot
Jouffray-Drillaud, Lusignan, FRA.
Joelle Ronfort
Joelle.Ronfort@supagro.inra.fr
INRA, UMR 1097 DGPC UMR INRA / ENSAM / IRD : Diversité et Génome des Plantes Cultivées. Centre de recherche de Montpellier, FRA.
Pierre Baudouin
GIE GRASS - La Litière, Saint Sauvant, FRA.
Philippe Barre
Philippe.Barre@lusignan.inra.fr
INRA, UR 0889 UGAPF Unité Génétique et Amélioration des Plantes Fourragères. Centre de recherche de Poitou Charentes, FRA.
Thomas Huguet
CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique - UMR CNRS-INRA 2594/441, Castanet-Tolosan, FRA.
Christian Huyghe
Christian.Huyghe@lusignan.inra.fr
INRA, UR 0889 UGAPF Unité Génétique et Amélioration des Plantes Fourragères. Centre de recherche de Poitou Charentes, FRA.
Bernadette Julier
Bernadette.Julier@lusignan.inra.fr
INRA, UR 0889 UGAPF Unité Génétique et Amélioration des Plantes Fourragères. Centre de recherche de Poitou Charentes, FRA.
Type de produit
Article
Année
2005
Langue
eng
Public visé
Scientifique
Résumé
Alfalfa (Medicago sativa) is an autotetraploid, allogamous and heterozygous species whose cultivars are synthetic populations. The breeders apply selection pressure for some agronomic traits within a breeding pool to increase the frequency of favorable individuals. The objective of this study was to investigate the differentiation level among seven cultivars originating from one breeding program, and between these cultivars and the breeding pool, with eight SSR markers. These highly polymorphic and codominant markers, together with recent population genetic statistics extended to autotetraploids, offer tools to analyse genetic diversity in alfalfa. The number of alleles per locus varied between 3 and 24. All loci were at a panmictic equilibrium in the cultivars, except one, probably because of null alleles. With seven SSR loci, each cultivar was at panmictic equilibrium. The mean gene diversity was high, ranging from 0.665 to 0.717 in the cultivars. The parameter F ST indicated a low but significant diversity among cultivars. Among 21 pairs of cultivars, 15 were significantly different. The breeding pool also had a high diversity, and was significantly different from each cultivar except the most recent one. Considering the characteristics of the breeding program and the mode of cultivar elaboration, we found that they were unable to generate a large variety differentiation. Estimation of population genetics parameters at SSR loci can be applied for assessing the differences between cultivars or populations, either for variety distinction or the management of genetic resources.
Anglais
Revue
Titre abrégé
Theor. appl. genet.
ISSN
0040-5752
Pages
1420-1429
Comité de lecture
Avec comité de lecture
Diffusion de la notice
Publique
Mots-clés chercheurs
Mots-clés INRA
Objet d'étude : medicago sativa ; luzerne
Phénomène, processus et fonction : ressource génétique ; caractère agronomique
Dispositif technique et méthode d'étude : marqueur moléculaire ; sélection végétale
Question sociétale et finalité, contexte : variabilité génétique
Notes
 
DOI
Localisation
UMR 1097 UMR INRA / ENSAM / IRD : Diversité et Génome des Plantes, Centre de recherche de Montpellier, 34130 MAUGUIO, FRA (Publis05-DGPC-006)
WOS
Liens
Comment citer ce document :
Flajoulot, S., Ronfort, J., Baudouin, P., Barre, P., Huguet, T., Huyghe, C., Julier, B. (2005). Genetic diversity among alfalfa (Medicago sativa) cultivars coming from a breeding program using SSR markers. Theoretical and Applied Genetics, 111 (7), 1420-1429. DOI : 10.1007/s00122-005-0074-4
http://prodinra.inra.fr/record/18659