A partir des données issues d’une campagne d’imagerie haute résolution aéroportée par drone réalisée au cours de l’été 2015 sur un verger d’essai de comportement de variétés de pommiers, ce mémoire a pour objet d’étudier l’apport de l’imagerie multispectrale dans l’étude de l’évolution de la réflectance de ce couvert végétal en réponse à l’imposition d’un stress hydrique pendant une durée de 1 mois. L’évolution des conditions de l’humidité du sol, et du statut hydrique des arbres (suivi par potentiel de base et potentiel de tige) a démontré la réalité de la situation de stress pour deux des cinq variétés mises en essai : notamment Story® Inoredcov. Le document rapporte en détail la procédure de vol pour l’acquisition des images, à 40m au-dessus du sol, ainsi que les méthodes de pré- et de post-traitement de ces images. A partir de celles-ci, diverses variables spectrales ont été extraites, et des indices de télédétection ont été calculés : NDVI, GNDVI, et PRI. Une acquisition en mode vidéo a permis parallèlement à l’imagerie multispectrale d’acquérir des images dans l’infrarouge thermique sur l’ensemble de la parcelle d’essai. Le traitement des données a révélé l’intérêt de combiner les bandes du rouge (676nm) et du proche infrarouge (850nm) pour le calcul du NDVI, qui s’avère négativement impacté par le stress hydrique, et il a confirmé que l’image thermique de la parcelle traduisait aussi l’état de stress de certains arbres, avec une élévation de la température de 1,1°C en moyenne pour les arbres privés d’eau. Une analyse en composantes principales construite sur la base des trois indices de végétation et de la variable Ts-Ta (température de surface moins température de l’air) a permis de montrer une relative indépendance des variables, et de les différencier les individus génétiquement et par rapport à la contrainte hydrique subie. L’expérimentation démontre ainsi le potentiel de l’imagerie multispectrale et thermique pour contribuer aux efforts de phénotypage non invasif sur couvert d’arbres fruitiers.