La persistance asymptomatique de Salmonella Enteritidis au niveau du tube digestif des volailles est une préoccupation majeure pour la sécurité alimentaire. Les mécanismes de ce portage sont encore mal connus. L'objectif de la thèse était de mettre en évidence les facteurs de l'immunité innée intestinale qui pouvaient être déficients chez les oiseaux fortement porteurs. Pour cela nous avons analysé l'expression différentielle des gènes de médiateurs inflammatoires et anti-infectieux en comparant des lignées de volaille plus ou moins porteuses de salmonelles. Nous avons pu montrer en particulier que la résistance au portage variait selon l'âge des animaux et que l'expression élevée des gènes de cytokines inflammatoires et des défensines était liée à un meilleur contrôle de la colonisation chez l'adulte mais pas chez le jeune. Ces résultats suggèrent que l'efficacité de ces facteurs dans la lutte des oiseaux contre le portage dépend de la maturation du système immunitaire.