Les premières cultures transgéniques datant de 1996, l'article cherche à en établir un bilan au niveau agro-économique en prenant le cas du soja tolérant à l'herbicide glyphosate, culture transgénique actuellement la plus répandue dans le monde et aux Etats-Unis. Le travail a notamment reposé sur l'acquisition, l'examen critique et l'analyse des données disponibles sur les résultats des premières années de production. On a cherché à comparer les cultures transgéniques aux conventionnelles en matière d'intrants utilisés, de rendements, de marges, de contraintes et/ou facilités culturales, de certains aspects environnementaux, etc. L'analyse fait apparaître une grande variabilité des résultats selon les conditions locales, ainsi qu'une évolution au cours du temps. Pour les agriculteurs américains qui l'utilisent, l'intérêt du soja transgénique ne paraît pas tenir à de seules considérations comptables sur les coûts ou la marge : si, malgré le surcoût des semences, la marge est assez souvent un peu améliorée par de moindres charges en traitements et/ou un rendement légèrement plus élévé, d'autres facteurs jouent, notamment la plus grande facilité et flexibilité du désherbage permise par le soja transgénique. Il convient de prendre en compte les interactions entre techniques, les variations interannuelles... Par ailleurs, l'analyse doit considérer aussi la dynamique d'évolution d'ensemble (baisse des cours du soja, diminution des prix des autres herbicides, évolution générale des exploitations et du contexte).