L'utilisation des marqueurs moléculaires en amélioration des plantes permet d'améliorer la prédiction sur la valeur génétique des génotypes. De nombreux travaux de génétique ont tenté de calculer le supplément de progrès génétique qu'il serait possible d'atteindre. Les estimations proposées sont cependant imparfaites car le coût supplémentaire lié au marquage moléculaire n'est pas pris en compte correctement. Cet article propose une méthode pour palier cette insuffisance. Pour la plupart des schémas envisagés dans la littérature scientifique, il est possible de voir que le coût relatif actuel du marquage moléculaire est généralement trop élevé pour que la sélection assistée par marqueur devienne intéressante. L'article conclut en proposant un certain nombre de schémas de sélection plus favorables à étudier par la suite.