La caractérisation des races bovines françaises a débuté en utilisant comme principales sources de données des études morphologiques. Progressivement, grâce à l’évolution des techniques d’analyse de la variabilité génétique, d’autres critères ont pu être pris en compte. Des données concernant le polymorphisme des groupes sanguins, de certaines protéines sériques et des protéines du lait ont permis de distinguer 4 sous ensembles de races bovines françaises. Cette étude va être approfondie par une analyse du polymorphisme au niveau de l’ADN en utilisant de nouveaux marqueurs plus nombreux et plus polymorphes : les microsatellites. Cet article présente la mise en place d’un projet d’étude du polymorphisme de 20 microsatellites dans 11 races bovines françaises choisies de façon à ce que les 4 sous-ensembles soient représentés. Les premiers résultats obtenus sur 6 races (Brune des Alpes (BU), Charolaise (CH), Montbéliarde (MO), Normande (NO), Parthenaise (PA) et Vosgienne (VO) ) avec six locus microsatellites (INRA013, INRA016, INRA035, INRA037, INRA040 et ETH131) sont décrits. Une répartition très différente des fréquences alléliques des microsatellites est observée d’une population à l’autre. Ces résultats préliminaires montrent que les microsatellites peuvent être de bons outils pour ce programme d’analyse phylogénique.