The Ectocarpus Genome and Brown Algal Genomics The Ectocarpus Genome Consortium - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Advances in Botanical Research Année : 2012

The Ectocarpus Genome and Brown Algal Genomics The Ectocarpus Genome Consortium

J. Mark Cock (1, 2) , Lieven Sterck (3, 4) , Sophia Ahmed (1, 2) , Andrew E. Allen (5) , Grigoris Amoutzias (3, 4) , Véronique Anthouard (6) , Francois Artiguenave (6) , Alok Arun (1, 2) , Jean-Marc Aury (7) , Jonathan H. Badger (5) , Bank Beszteri (8) , Kenny Billiau (3, 4) , Eric Bonnet (3, 4) , John H. Bothwell (9, 10) , Chris Bowler (11, 12) , Catherine Boyen (1, 2) , Colin Brownlee , Carl J. Carrano , Benedicte Charrier , Ga Youn Cho , Susana M. Coelho , Jonas Collen , Gildas Le Corguillé , Erwan Corre , Laurence Dartevelle , Corinne da Silva (7) , Ludovic Delage , Nicolas Delaroque , Simon M. Dittami , Sylvie Doulbeau , Marek Elias , Garry Farnham , Claire M. M. Gachon , Olivier Godfroy , Bernhard Gschloessl , Svenja Heesch , Kamel Jabbari , Claire Jubin , Hiroshi Kawai , Kei Kimura , Bernard Kloareg , Frithjof C. Kuepper , Daniel Lang , Aude Le Bail , Rémy Luthringer , Catherine Leblanc , Patrice Lerouge , Martin Lohr , Pascal J. Lopez , Nicolas Macaisne , Cindy Martens , Florian Maumus , Gurvan Michel , Diego Miranda-Saavedra , Julia Morales , Herve Moreau , Taizo Motomura , Chikako Nagasato , Carolyn A. Napoli , David R. Nelson , Pi Nyvall-Collén , Akira F. Peters , Cyril Pommier , Philippe Potin , Julie Poulain , Hadi Quesneville , Betsy Read , Stefan A. Rensing , Andrés Ritter , Sylvie Rousvoal , Manoj Samanta , Gaelle Samson , Declan C. Schroeder , Delphine Scornet , Béatrice Ségurens , Martina Strittmatter , Thierry Tonon , James W. Tregear , Klaus Valentin , Peter von Dassow , Takahiro Yamagishi , Pierre Rouzé , Yves van de Peer , Patrick Wincker
Véronique Anthouard
  • Fonction : Auteur
Francois Artiguenave
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 908642
Chris Bowler
Colin Brownlee
  • Fonction : Auteur
Carl J. Carrano
  • Fonction : Auteur
Benedicte Charrier
  • Fonction : Auteur
Ga Youn Cho
  • Fonction : Auteur
Susana M. Coelho
Jonas Collen
  • Fonction : Auteur
Gildas Le Corguillé
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 881105
Erwan Corre
Laurence Dartevelle
  • Fonction : Auteur
Ludovic Delage
  • Fonction : Auteur
Nicolas Delaroque
  • Fonction : Auteur
Simon M. Dittami
Sylvie Doulbeau
  • Fonction : Auteur
Marek Elias
  • Fonction : Auteur
Garry Farnham
  • Fonction : Auteur
Claire M. M. Gachon
Olivier Godfroy
Bernhard Gschloessl
  • Fonction : Auteur
Svenja Heesch
  • Fonction : Auteur
Kamel Jabbari
  • Fonction : Auteur
Claire Jubin
  • Fonction : Auteur
Hiroshi Kawai
  • Fonction : Auteur
Kei Kimura
  • Fonction : Auteur
Bernard Kloareg
  • Fonction : Auteur
Frithjof C. Kuepper
  • Fonction : Auteur
Daniel Lang
  • Fonction : Auteur
Aude Le Bail
  • Fonction : Auteur
Rémy Luthringer
  • Fonction : Auteur
Catherine Leblanc
Patrice Lerouge
  • Fonction : Auteur
Martin Lohr
  • Fonction : Auteur
Pascal J. Lopez
  • Fonction : Auteur
Nicolas Macaisne
  • Fonction : Auteur
Cindy Martens
  • Fonction : Auteur
Florian Maumus
Gurvan Michel
Diego Miranda-Saavedra
  • Fonction : Auteur
Julia Morales
Herve Moreau
  • Fonction : Auteur
Taizo Motomura
  • Fonction : Auteur
Chikako Nagasato
  • Fonction : Auteur
Carolyn A. Napoli
  • Fonction : Auteur
David R. Nelson
  • Fonction : Auteur
Pi Nyvall-Collén
  • Fonction : Auteur
Akira F. Peters
  • Fonction : Auteur
Cyril Pommier
Philippe Potin
  • Fonction : Auteur
Julie Poulain
Hadi Quesneville
Betsy Read
  • Fonction : Auteur
Stefan A. Rensing
  • Fonction : Auteur
Andrés Ritter
  • Fonction : Auteur
Sylvie Rousvoal
  • Fonction : Auteur
Manoj Samanta
  • Fonction : Auteur
Gaelle Samson
  • Fonction : Auteur
Declan C. Schroeder
  • Fonction : Auteur
Delphine Scornet
Béatrice Ségurens
  • Fonction : Auteur
Martina Strittmatter
  • Fonction : Auteur
Thierry Tonon
James W. Tregear
  • Fonction : Auteur
Klaus Valentin
  • Fonction : Auteur
Peter von Dassow
  • Fonction : Auteur
Takahiro Yamagishi
  • Fonction : Auteur
Pierre Rouzé
  • Fonction : Auteur
Yves van de Peer
Patrick Wincker

Résumé

Brown algae are important organisms both because of their key ecological roles in coastal ecosystems and because of the remarkable biological features that they have acquired during their unusual evolutionary history. The recent sequencing of the complete genome of the filamentous brown alga Ectocarpus has provided unprecedented access to the molecular processes that underlie brown algal biology. Analysis of the genome sequence, which exhibits several unusual structural features, identified genes that are predicted to play key roles in several aspects of brown algal metabolism, in the construction of the multicellular bodyplan and in resistance to biotic and abiotic stresses. Information from the genome sequence is currently being used in combination with other genomic, genetic and biochemical tools to further investigate these and other aspects of brown algal biology at the molecular level. Here, we review some of the major discoveries that emerged from the analysis of the Ectocarpus genome sequence, with a particular focus on the unusual genome structure, inferences about brown algal evolution and novel aspects of brown algal metabolism.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02649287 , version 1 (29-05-2020)

Identifiants

Citer

J. Mark Cock, Lieven Sterck, Sophia Ahmed, Andrew E. Allen, Grigoris Amoutzias, et al.. The Ectocarpus Genome and Brown Algal Genomics The Ectocarpus Genome Consortium. Advances in Botanical Research, 2012, 64, pp.141 - 184. ⟨10.1016/B978-0-12-391499-6.00005-0⟩. ⟨hal-02649287⟩
63 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More