L'expansion des marques commerciales dans les filières agroalimentaires s'accompagne de la mise en place de nouvelles relations entre les différents stades de ces filières. Existe-t-il une diversité de ces relations interentreprises ou au contraire assiste-t-on à l'émergence d'une forme type. L'objectif de cette communication est de proposer une grille d'analyse de ces formes d'organisation. L'élaboration de cette grille est menée dans le cadre de l'économie des coûts de transaction. A partir de l'identification d'un ensemble de caractéristiques de relations interentreprises, nous établissons une typologie des modes de gouvernance qui affine et précise la catégorisation traditionnelle marché-forme hybride-hiérarchie. Cette typologie permet d'explorer le lien entre exploitation d'une marque commerciale et modes de gouvernance des transactions dans la filière. Notre analyse se base sur l'étude approfondie de trois marques commerciales et des relations interentreprises afférentes : une marque distributeur ayant récemment mis en place une filière qualité dans le secteur de la viande bovine, une marque de transformateur dans le secteur des légumes transformés, une marque développée par la filiale de plusieurs coopératives dans le secteur de la tomate.