Mise au point d'outils de q-PCR pour la détection et la quantification des deux groupes génétiques (A, B), de la résistance aux DMIs et aux QoIs chez l'oïdium de la vigne (Erysiphe necator) en France - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2009

Real time PCR assays for quantification and differentiation of Erysiphe necator genetic groups in grapevine samples

Mise au point d'outils de q-PCR pour la détection et la quantification des deux groupes génétiques (A, B), de la résistance aux DMIs et aux QoIs chez l'oïdium de la vigne (Erysiphe necator) en France

Résumé

Real time PCR assays using SYBR green technology were developed to detect and quantify several Cyp51 gene SNPs and one mitochondrial cyt b gene SNP of grapevine powdery mildew (Erysiphe necator). These tools allowed to identify and quantify the two genetic groups A and B of E. necator, the presence or absence of a high resistance to fungicides DMIs (Demethylase inhibitors), and the presence or absence of resistance to QoIs (Quinone outside inhibitor) in powdery mildew populations in French vineyard. Fifty populations sampled in six French regions were used, describing a new picture of E. necator population diversity in French vineyard.
Des outils de détection et de quantification rapides ont été développés pour Erysiphe necator (l’oïdium de la vigne) pour évaluer la distribution des deux groupes génétiques A et B dans le vignoble français, ainsi que le niveau de résistance aux fongicides IDMs (Inhibiteur de la C14-sterol déméthylase) et QoIs (Quinone outside inhibitor, inhibiteur de la respiration mitochondriale). Sur la base de la détection de différents SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) positionnés respectivement en position G37V et Y136F du gène Cyp51 de la C14-éburicol déméthylase et en position G143A du gène mitochondrial du cytochrome b, différents marqueurs de PCR quantitative ont été développés et testés dans le vignoble français. Cinquante populations d’oïdium de la vigne collectées en 2008 et provenant de différentes régions ont permis de décrire un nouvel état de la variabilité et de la résistance de l’oïdium de la vigne en France.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02757394 , version 1 (04-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02757394 , version 1
  • PRODINRA : 36538

Citer

Marie-Cecile M.-C. Dufour, S. Fontaine, A. Micoud, Marie-France Corio-Costet. Mise au point d'outils de q-PCR pour la détection et la quantification des deux groupes génétiques (A, B), de la résistance aux DMIs et aux QoIs chez l'oïdium de la vigne (Erysiphe necator) en France. 9. Conférence internationale sur les maladies des plantes, Dec 2009, Tours, France. ⟨hal-02757394⟩

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