Le thème central du stage concernait l’étude de la population bactérienne présente dans le tractus digestif (cæcum chez le lapin, rumen chez la vache). Selon les conditions expérimentales les variations de la répartition des espèces bactériennes dans l'échantillon peuvent être importantes. En effet l'alimentation ou les conditions d'élevage peuvent engendrer une variation dans la composition et l'abondance des populations bactériennes. L'équipe NED étudie l'influence des facteurs de variations sur dans la population bactérienne. Le but étant d'améliorer la rentabilité et la qualité de l'élevage en jouant sur les conditions expérimentales pour obtenir une flore bactérienne bénéfique aux modèles.