Conservation, characterisation and management of grapevine genetic resources: the European project GrapeGen06
Résumé
Since 2007, research institutes and grapevine collections from 17 countries of Europe, Caucasus and North Africa are working together for the conservation, characterization and management of grapevine genetic resources. The initial work consisted in inventorying and describing the varieties in the partners’ collections, using standardized morphological, agronomic, and molecular descriptors, and to link the information into a unique European web-database. The growing database contains today passport data from 25.000 living accessions, of which 2.500 are linked to photos and 1.600 are characterized for 48 OIV descriptors and 9 microsatellite markers. The project is also working on 448 old autochthonous varieties that have presented a regional interest in the past but are not clearly identified. Comparing their microsatellite fingerprint with the total database will enable us to find if they are original resources and to uniquely define their traits. The database website is open for consultation, with different levels of access that allows indept searches but also confidentiality, according to the user needs. At the end of 2010, the fingerprint data will also be online, so that other collections or professionals can check their own varieties against the referenced varieties to verify names and true-to-typeness. The final objective of the European project is to promote an optimized conservation scheme of the Vitis germplasm, involving ex-situ, cryo- and on-farm conservation, so that the resources are permanently maintained, easily accessible and field-tested in a pertinent agricultural context. This network of resources will also provide plant material as a basis for biotechnology, genomic and breeding research.
Depuis 2007, les institutes de recherche et les collections de vigne de 17 pays d’Europe, du Caucase et d’Afrique du Nord collaborent pour la conservation, la caractérisation et la gestion des ressources génétiques de vigne. Le travail initial a consisté à inventorier et décrire les variétés des partenaires, en utilisant des descripteurs morphologiques, agronomiques et moléculaires standard, et liant l’information dans une base de données européenne unique. La base de données grandissante contient aujourd’hui les données passeport de 25.000 accessions vivantes, dont 2.500 sont décrites par des photos et 1.600 sont caractérisées pour 48 descripteurs OIV et 9 marqueurs microsatellite. Le projet travaille également sur 448 variétés autochtones ayant présenté un intérêt régional dans le passé mais mal identifiées. Comparer leur profile microsatellite avec l’ensemble des données nous permettra de déterminer leur originalité et de définir de manière non-équivoque leurs caractéristiques. La base de données est ouverte au public, et prévoit des niveaux d’accès différents, pour permettre les recherches approfondies ainsi que la confidentialité, selon les besoins de l’utilisateur. Fin 2010, les données moléculaires seront également publiques, permettant aux professionnels de vérifier la conformité de leurs variétés. 3 L’objectif final du projet européen est de promouvoir un schéma optimal de conservation des ressources de vigne, impliquant conservation ex-situ, la cryo-preservation et la conservation à la ferme, pour pérenniser les ressources de vigne, les rendre facilement accessibles et les tester dans leur contexte agricole. Ce réseau de ressources fournira également le matériel de base pour la recherché en biotechnologie, génomique et sélection.
Dal 2007, gli istituti di ricerca e le collezioni di vite di 17 paesi d’Europa, del Caucaso e del Nord-Africa collaborano per la conservazione, la caratterizzazione e la gestione delle risorse genetiche della vite. Inizialmente, il lavoro ha consistito nell’inventario e la descrizione delle varietà delle collezioni partner, utilizzando descrittori morfologici, agronomici e molecolari standardizzati, le cui informazioni sono poi inserite in un unico database Europeo. Il database sta crescendo e contiene oggi i dati passaporto di 25.000 varietà viventi, di cui 2.500 sono descritte da foto e 1.600 da 48 descrittori OIV e 9 marcatori microsatelliti. Il progetto sta inoltre lavorando su 448 antiche varietà autoctone che hanno presentato un interesse regionale nel passato, ma che sono mal identificate. Comparare il loro profilo genetico con il database permetterà di determinare la loro originalità e di definire inequivocabilmente le loro caratteristiche. Il database e’ accessibile al pubblico, e prevede diversi livelli di accesso permettendo una ricerca approfondita e allo stesso tempo la confidentialità, secondo i bisogni degli utilizzatori. Alla fine del 2010, la base dei marcatori molecolari sarà ugualmente aperta, permettendo cosi’ ai professionisti di verificare la conformità delle loro varietà. L’obiettivo finale del progetto europeo e’ di organizzare uno schema ottimale di conservazione delle risorse di Vitis, facendo ricorso a metodi ex-situ, di crio-preservazione e conservazione in fattoria, permettendo la perenizzazione delle risorse, rendendole facilmente accessibili e analizzandole nel contesto agricolo. Questa rete di collaborazione potrà anche provvedere materiale di base per la ricerca in biotecnologia, genomica e selezione.