Évaluation par marqueurs moléculaires microsatellites de la diversité d’une collection d’aulnes glutineux provenant de Wallonie (Belgique), de Lorraine (France) et du Grand-Duché du Luxembourg
Résumé
Fourteen microsatellite markers were used to identify genotypes in a collection of 149 black alders (Alnus glutinosa) from an area covering Wallonia in Belgium, Lorraine in France and the Grand Duchy of Luxembourg. The objectives were to provide a tool for managing the collection and tracing the trees, to characterize black alder diversity in the region and to compare the diversity of the collection with the diversity of a population from the same region. The probability of identity varied from 7.5 10-1to 6.2 10-3, depending on the marker used, with a combined probability of 1.410-14for the 14 markers used simultaneously. These markers therefore proved to be a powerful tool for distinguishing black alder genotypes. Three of the markers were enough to discriminate 99 coppiced alder stools from a riverbank and highlight visual identification errors within these coppices. The microsatellite markers revealed high allelic diversity, with 176 alleles detected in the collection and the number of alleles per microsatellite locus ranging from 2 to 31. The observed heterozygosity of the collection ranged from 0.149 to 0.845, depending on the marker. An analysis of an alder population (25 trees tested) from the same region using the same microsatellite markers revealed close similarity among the most frequent alleles and no significant difference in frequency between the clonal collection and the population. This result showed that the allelic diversity of the collection was representative of a natural population from the same region.
Quatorze marqueurs microsatellites ont été utilisés afin de génotyper une collection (149 individus) d’aulnes glutineux (Alnus glutinosa) collectés dans la zone transfrontalière couvrant la Wallonie (Belgique), la Lorraine (France) et le Grand- Duché du Luxembourg. Les objectifs poursuivis étaient de disposer d’un outil de gestion et de traçabilité de la collection, de caractériser la diversité présente dans la région et de caractériser la diversité de la collection en regard de la diversité présente dans un peuplement issu de la même région. La probabilité de trouver deux génotypes différents qui ne soient pas discriminés varie de 7,5.10-1 à 6,2.10-3 en fonction du marqueur utilisé avec une probabilité d’identité combinée de 1,4.10-14 pour l’ensemble des 14 marqueurs. Ces marqueurs constituent donc un outil de discrimination performant. Nous montrons par ailleurs que trois de ces marqueurs suffisent à distinguer 99 cépées d’aulnes issues des bords d’un cours d’eau et à mettre en évidence des erreurs d’identification visuelle de ces cépées. Les marqueurs microsatellites utilisés mettent en évidence une grande diversité allélique au sein de la collection avec un total de 176 allèles détectés ; le nombre d’allèles par marqueur variant de 2 à 31. Le taux d’hétérozygotes observé dans la collection varie de 0,149 à 0,845 en fonction du marqueur. L’utilisation du même groupe de 14 marqueurs sur un peuplement (25 arbres testés) issu de la même région montre que les allèles les plus fréquents sont identiques et que la fréquence de ces allèles ne diffère pas significativement entre la collection et la population ; l’assortiment allélique de la collection est donc représentatif de celui d’un peuplement de la région considérée.